氢氧化钙可诱导和促进修复性牙本质形成。牙髓表层和氢氧化钙接触会发生破坏分解，坏死层刺激深部牙髓组织，诱发其修复潜力。间质细胞和成纤维细胞增殖，纤维增生并从无序状态逐渐排列成与表层成垂直，并深入胶原基质中。而成纤维细胞逐渐分化为成牙本质细胞，形成管状及骨样牙本质。此后钙盐沉积，牙本质桥钙化，凝固坏死层完全消失.此外，因氢氧化钙由于具有强碱性，故对龋坏牙本质的细菌有一定的杀菌作用.氢氧化钙可以控制感染并减少根管治疗期间疼痛的发生，显著优于传统药物如甲醛甲酚和樟脑酚。氢氧化钙的抗菌性主要来自它的OH-，这些离子可以迅速导致脂类过氧化，增加细菌细胞膜的通透性；导致蛋白质变性，酶失活；导致DNA破坏，使细菌死亡.氢氧化钙在口腔内科已广泛应用。其治疗机理已被深入研究，其疗效也得到肯定。近年来，CH作为根管内消毒药物，日益受到关注。